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导读

大部分的液体活检使用cfDNA分析突变，虽然可一次检测与临床治疗相关的多种变异类型，但在鉴定和表征基因融合突变上仍然存在一些局限。有些融合仅发生在RNA层面或DNA层面融合丰度低，仅从DNA层面难以检测到；一些存在长内含子或重复序列的融合，难以从DNA层面推测融合断点。而RNA测序能够有效避免这些融合的漏检，包括NTRK融合。

RNA测序准确确定融合伴侣

精准治疗的关键在于精准检测出可治疗靶点的变异，研究证明一些驱动基因融合的融合伴侣会影响治疗应答和治疗结果[1],而RNA测序可以确定确切的融合伴侣和融合外显子。

例如，EML4-ALK融合有不同的突变亚型，NSCLC（非小细胞肺癌）患者中最常见的ALK-EML4突变体是V1(EML4(exon13)-ALK(exon20))和V3(EML4(exon6)-ALK(exon20))。虽然融合伴侣基因相同，但融合区域不同，两种融合突变体对治疗的耐药性有明显差异。接受ALK抑制剂治疗的患者会产生GR突变,该突变是ALK阳性NSCLC患者最常见的耐药机制之一，而该突变仅在V3的患者中出现。

DNA+RNA提高临床获益率

基于RNA的NGS方法能够精准发现融合突变之外，还能弥补DNA检测的局限性。在斯隆-凯特琳纪念肿瘤中心的一项研究中[2]，例DNA-NGS组织活检驱动突变阴性的NSCLC患者中，通过RNA-NGS方法检测发现仍有15%（36/）的患者检出可进行靶向治疗的融合基因，且经过靶向治疗后，临床获益率达80%。研究人员通过RNA测序还发现了DNA测序未检出的基因融合和METExon14跳跃突变。

RNA-NGS融合检测

获NCCN指南推荐

V1版非小细胞肺癌NCCN指南指出[3]，对于通过panel基因检测未发现驱动基因的患者（尤其是不吸烟者），推荐使用RNA水平的NGS检测来最大化的发现融合基因，避免漏检。同时对于ALK、ROS1、NTRK等融合的检测也推荐使用基于RNA的NGS方法。

METExon14跳跃突变是NSCLC重要的治疗靶点，近年来新药迭出。指南也指出NGS检测是METExon14跳读的最主要检测方法，基于RNA的NGS测序方法在METExon14跳读的检测上表现出更多优势；在RET融合/重排的检测上，RNA-NGS检测要优于DNA-NGS检测。

cfDNA+cfRNA联检

精准检测融合

RNA-NGS检测融合的优势虽然很多，仅使用DNA或RNA尚不能完整发挥NGS的这一高通量测序技术的全方位优势。

路胜一直致力于全面而精准的液体活检技术和产品。推出全球首个cfDNA+cfRNA联合检测产品LiquidHALLMARK?,提升融合基因检测的准确度，有效避免漏检。LiquidHALLMARK?涵盖cfDNA层面的80个基因，10个基因融合和体细胞突变，以及cfRNA层面的27个基因融合。通过DNA+RNA联合检测更灵敏地检出具有临床意义的融合，指导进行更精准的治疗决策，实现癌症治疗的全程管理。参考文献[1]SvenjaWagener-RyczekRobertoPappesch()TargetedRNA-sequencingfortheevaluationofgenefusionsinlungtumors:currentstatusandfutureprospects,ExpertReviewofMolecularDiagnostics,21:6,-,DOI:10./..[2].HighYieldofRNASequencingforTargetableKinaseFusionsinLungAdenocarcinomaswithNoMitogenicDriverAlterationDetectedbyDNASequencingandLowTumorMutationBurden.ClinicalCancerResearch.;25(15):-.[3].NCCNclinicalpracticeguidelinesinOncology:Non-SmallCellLungCancer.Version1..预览时标签不可点收录于合集#个上一篇下一篇