非淋患者如果得不到及时的治疗，男性可合并附睾炎、前列腺炎、尿道狭窄和不育症;女性则可合并急性输卵管炎、子宫内膜炎、宫外孕以及不孕症。因此，一旦被确诊为非淋，患者就应及时治疗，以期早日痊愈。
需要注意的是，医院就诊时别忘了带上自己的性伴侣，如果性伴侣也被确诊为非淋，应一同治疗，以防再度相互传染。此外，由于大部分淋病患者常常合并有衣原体感染，而目前我国的许多地区应用衣原体抗原检测法的漏诊率相当高，因此，在对淋病患者进行治疗时应同时使用治疗衣原体感染的药物。
非淋菌性尿道炎治愈标准：
1、临床症状消失1周以上，尿道无分泌物，或分泌物中白红胞≤4个/倍显微镜。
2、尿液澄清，沉渣镜检阴性。
3、尿道(宫颈)标本衣原体、支原体检查阴性(有条件时)。
非淋菌性尿道炎注意事项
1、治疗期间不许饮酒。
2、当完成一个疗程后应进行随访。
3.患者是否按时按量治疗。服药次数多，持续时间长，患者容易因公因事而忘记服药，或者1~2天后基本消失而停服，影响疗效或复发。此时不要急于改换药物。
4、由于目前有多达45%的淋病患者在感染淋球菌的同时也感染衣原体和支原体，因此，在治疗淋病时，可采取同时治疗非淋菌性尿道炎联合方案。
5、性伴侣如有感染应同时治疗。经治疗，病人的症状持续存在，或症状消失后又复发，最可能的原因是性伴侣未经治疗。未经治愈与性伴侣性交，病菌由未经治疗的性伴侣再次传给患者。须知有40%的非淋菌性尿道炎患者是没有任何症状。所以不但患者本身要治疗，其性伴侣也应接受预防性的药物治疗。方法与患者相同，如为孕妇，可用红霉素或阿莫西林治疗。
6、医院治疗而未愈的患者。要详细了解病情和疗程，若按正规疗法而无好转或无效者，应改换另一种方法，甚至联合治疗。联合治疗时一般不要用同类抗生素。
7、若证实为沙眼衣原体尿道炎患者，再次治疗时把疗程延长到4—6周可效。
8、已有不少报告分解尿素支原体对四环素有耐药性，若疑属于这种情况，则及时用其他抗生素。
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